药用纯水对水质要求特别高，尤其是注射液体药物。大多数微生物在医用纯水处理过程中已经被去除，但即使采用微滤、超滤等方法处理水，水中的细菌物质也无法完全去除。而且一般的水质处理方法更不能去除微生物。为了保证产品的高质量和消费者的健康，必须对水进行消毒，注意储罐、管道、阀门等卫生状况，防止水的二次污染。
水消毒的目的是杀灭水中的致病菌，使水中的细菌含量达到规定的标准。臭氧消毒是常用的水消毒方法。
臭氧消毒的原理； 臭氧消毒的原理是臭氧在水中发生氧化还原反应，产生氧化能力强的单原子氧(O)和羟基(OH)，瞬间分解水中的有机物、细菌和微生物。羟基(OH)是一种强氧化剂和催化剂，能使有机物发生连锁反应，反应非常快。羟基(OH)对各种致病微生物有很强的杀灭作用。单原子氧(O)还具有很强的氧化能力，对病毒、孢子等顽强微生物有很强的杀伤力。 臭氧对药物纯水消毒参数的选择。
建议纯水消毒处理参数为：水溶性臭氧浓度0.3mg/l-0.5mg/L，臭氧浓度5g/T。
